Eosmon'a karşı verilen savaştan iki yıl sonra Davis Motomiya, Ken Ichijouji, Yolei Inoue, Cody Hida, TK Takaishi ve Kari Kamiya, güçsüz bir Digivice ile bulunan ve ilk Digidestined olduğunu iddia eden Rui Owada adında bir çocukla tanışır. Buna ek olarak, gerçek dünyada Ukkomon adında bir Digimon ortaya çıkar ve dünyadaki her insanın kendi Digimon partnerine sahip olmasını ister.