Saint Mikhailov Akademisi'nin eski müdürü olan Tomo Yamanobe'nin babası ortadan kaybolduğunda, geride “ikon” adlı bir sanat eseri dışında hiçbir şey bırakmadı. Kaybolmasından kısa bir süre sonra, akademinin kız öğrencilerine saldıran bir seri katil olduğu söylentileri yayılmaya başladı.
Tomo ve kız kardeşi Mafuyu Oribe okulda eziyet gördükten sonra eve dönerken, Tomo yaralı gümüş saçlı bir çocuğa takılır ve ona yardım ederken çocuk aniden ortadan kaybolur. Mafuyu onu aramaya gider, ancak ikonun bulunduğu kilisenin yandığını fark eder. Resmi kurtarmaya çalıştığında, söylentilere göre seri katil, magnezyumu kontrol etme yeteneği ile ona aniden saldırır. Birdenbire ortaya çıkan, demiri kontrol edebilen gümüş saçlı çocuk Mafuyu'yu kurtarır.
Mafuyu, Alexander Nikolaevich “Sasha” Hell adlı çocuğun, emzirme yoluyla aldığı ‘soma’ gücüyle elementleri kontrol edebilen bir “qwaser” olduğunu öğrenir. Bu zorlu deneyimden kafası karışan Mafuyu, Sasha ertesi gün onun sınıfına transfer olunca, bu durumu atlatmaya çalışır ama pek başarılı olamaz. Diğer qwaserlerin tehlikesi başlarına çöktüğü halde, Tomo ve Mafuyu'nun normal okul hayatı nasıl devam edecek?
Sosyal hayattan uzak durarak yaşamak isteyen, ağır otaku Tsutsui Hikari, gerçek dünyadaki kızlar yerine sanal kızları tercih etmektedir. Günün birinde okul havuzunun etrafındaki çöpleri temizleme cezası alır fakat aynı cezayı Iroha adındaki “gerçek bir kız” da almıştır. Tsutsui, normal şartlarda konuşma şansı bile olamayacak kadar güzel bir kızla arkadaş olur ve ikilinin yolları daha fazla kesişmeye başlar.
