Şehrin gürültüsünden uzakta Torishirojima uzanmaktadır; zamanın yavaş aktığı şirin ve huzurlu bir ada. Kalbi yaralı genç bir delikanlı olan Hairi Takahara, büyükannesinin yakın zamanda ölümünü, Torishirojima'ya gitmek üzere şehirden ayrılmak için sessiz bir neden olarak kullanır.
Adaya ulaştığında Hairi, kendisini alışkın olduğu koşuşturmadan çok farklı, ferahlatıcı ve rahat bir atmosferle çevrili bulur. Teyzesi Kyouko Misaki'nin yanına taşındıktan sonra, yazı büyükannesinin yıllar boyunca topladığı eserlerle dolu bir kulübeyi, onlarla birlikte kalan kuzeni Umi Katou ile birlikte düzenlemeye yardım ederek geçirmeye hazırlanır.
Adanın yavaş temposuna alışmaya çalışan Hairi, boş zamanlarını keşfederek geçirmeye karar verir. Çok geçmeden neşeli Tsumugi Wenders; antisosyal Shiroha Naruse; gezgin Kamome Kushima ve sivri dilli Ao Sorakado ile tanışır. Onların hayatlarının ve adanın ince gizemlerinin içine çekilen Hairi, eğlence, nostalji ve hayatını değiştirecek anlarla dolu bir yaza adım adım sürüklenir.
Hikâyemiz, bir grup ergenlik çağındaki kız ve erkeğin arasında görülen özel yetenekleri konu almaktadır. Yuu Otosaka gücünü kimseye bir şey belli etmeden kullanıp, normal, sıradan bir okul hayatı yaşamaktadır. Birdenbire karşısına Nao Tomori adında bir kız çıkar. Onunla karşılaşmasından dolayı, özel güç kullanıcılarının kaderi açığa çıkacaktır.
Lisenin son yaz tatilinin sonunda, Youta Narukami günlerini üniversiteye giriş sınavlarına hazırlanarak geçirirken Hina isimli bir genç kız aniden karşısına çıkar ve kendisinin "her şeyi bilen tanrı" olduğunu iddia eder. Youta'nın kafası karışır ve dünyanın 30 gün içinde sonunun geleceğini söyleyen Hina'ya inanmaz. Hina'nın tanrısal öngörü yeteneğine şahitlik ettikten sonra Youta, Hina'nın güçlerinin gerçek olduğuna inanmaya başlar. Doğaüstü güçlerine rağmen saf ve çocuk gibi olan Hina bir nedenden dolayı Youta'nın evinde kalmaya karar verir. Böylece dünyanın sonundan önceki yaşam dolu yazları başlar.
