Altın bir güneşin sıcaklığında, çekingen lise öğrencisi Haruka Suzumiya, hayranı olduğu Takayuki Narumi'ye itirafta bulunur. Takayuki, Haruka'nın itirafını kabul eder ve ikili, ortak arkadaşları Mitsuki Hayase ve Shinji Taira tarafından desteklenen bir çift olur. Bu arkadaşlar için her şey yolundadır, ta ki bir trajedi yaşanana kadar.
İçlerinden biri, bir komada uykuda yatarak kötü bir kadere mahkum olur. Üç yıl sonra uyanırlar, ancak herkesin hayatında aniden yeniden ortaya çıkmaları, bu arkadaşların bağlarının sınırlarını test etmekle tehdit eder.
Kraliyet ailesinden gelen Pacifica Casull, 16. doğum gününde dünyayı yok edeceğini söyleyen kıyamet kehanetinin ardından “Hurdaya Çıkmış Prenses” lakabını almıştır. İyi kalpli bir aile tarafından ölümden kurtarılan Pacifica, kendisini evlat edinen ağabeyi ve ablası Shannon ve Raquel Casull'un yanına sığınır. Hayatta kaldığına dair haberler Tanrı Mauser'e tapanların kulağına gittiğinde, ne pahasına olursa olsun ölmesini isterler ve Pacifica'yı canını kurtarmak için kaçmaya zorlarlar.
Kiliseden, soylulardan ve hatta sıradan insanlardan gelen tehditlerle boğuşan üç kardeş, Pacifica'nın kaderinde yazılanı atlatmaya çalışırken bir yandan da bir kızın hayatının dünyanın sonunu getirmeye değip değmeyeceğini sorgularlar. Hurdaya Çıkmış Prenses'in gerçek doğası, dünyanın kendisinin üzücü ifşaatlarıyla birlikte, prensesin 16. doğum günü hızla yaklaşırken giderek daha belirgin hale gelir.
